恒湿箱系统的运作是通过三个相互联系的系统：制冷剂循环系统、空气循环系统、电器自控系统;
.制冷剂循环系统：蒸发器中的液态制冷剂吸收空气的热量（空气被降温及除湿）并开始蒸发，终制冷剂与空气之间形成定的温度差，液态制冷剂亦完全蒸发变为气态，后被压缩机吸入并压缩（压力和温度增加）,气态制冷剂通过冷凝器（风冷/水冷）吸收热量，凝结成液体。通过膨胀阀节流后变成低温低压制冷剂进入蒸发器，完成制冷剂循环过程。
二.空气环系统：风机负责将空气从回风口吸入，空气经过蒸发器（降温、除湿），加湿器，电加热器（升温）后经送风口送到用户需的箱体内，送出的空气与箱体内的空气混合后回到回风口。
三.电器自控系统：电器自控系统包括电源部分和自动控制部分。1.电源部分通过接触器，对压缩机、风扇、电加器器，加湿器等供应电源 2.自动控制分部分又分为温、湿度控制及故障保护部分:1).温、湿度控制是通过温、湿度控制器，将回风的温湿度与用户设定的温湿作对比，自动运行压缩机（降温、除湿），加湿器，电加热（升温）等元件，实现恒温恒湿的自动控制2).故障保护控制是通过压力保护、延时器、继电器、过载保护等相互组合达到，对压缩机，风机，加湿器等元件进行故障保护的控制恒温恒湿箱。
